A substituição do filtro do combustível deve ser confiada a profissionais já que a peça está localizada num local dificilmente acessível, o que dificulta a desmontagem por si mesmo. Além disso, depois de terminar os trabalhos, é importante encher adequadamente o filtro com combustível e sangrar o sistema de combustível. Normalmente, nos carros mais recentes existem dois filtros de combustível: um grosso e um fino. Isto acontece em carros a gasolina e diesel. O filtro grosso tem como finalidade parar as partículas maiores e está sempre montado no depósito de combustível. O filtro fino filtra as poeiras mais pequenas e pode estar localizado no depósito de combustível, ou ainda no compartimento do motor ou sob o carro, antes ou depois da bomba de combustível.

Os filtros de combustível nos carros a diesel devem ser substituídos a cada mudança de óleo - em média a cada 10.000 a 15.000 quilómetros. Nos carros a gasolina devem ser substituídos após cada segunda ou terceira mudança de óleo, em média a cada 20.000 a 30.000 quilómetros. A instalação fora de tempo de um novo filtro deve ser feita caso tenha notado um aumento no consumo de combustível, uma redução na potência do motor ou deterioração da dinâmica do carro ou outros sinais que indiquem a avaria deste elemento.

É melhor instalar filtros de fabricantes como Bosch, Champion, Febi Bilstein, Filtron, Knecht, Stark Professional Line, Magneti Marelli, Ridex, Delphi, Mahle Original, Mann-filter, Mapco, Swag, Topran, Vaico e Valeo. Os produtos destas empresas destacam-se pela elevada qualidade e servirão durante muito tempo. Adicionalmente, é importante escolher os componentes de acordo com os requisitos técnicos do veículo. Por exemplo, para motores diesel os filtros do combustível podem fazer a separação da humidade de forma separada da limpeza de contaminantes do combustivel.